Avdelningen Utveckling och kompetens leds av Ulrika Worge Carlsson, och omfattar HR, IT och Verksamhetsutveckling.
HR-enheten svarar för verkets personalpolitik, organisationsutveckling, anställning av personal, arbetsmiljö, personalsociala frågor samt förhandlingar och avtal avseende verkets personal. Vidare ansvarar enheten för samordning av verksamhetsutveckling, utbildningsverksamhet och kompetensutvecklingsfrågor. Enheten svarar också för reception samt växel. Christina Burlin är chef för HR-enheten.
IT-enheten ansvarar för strategisk styrning av IT-verksamheten med målet att skapa förutsättningar för Sjöfartsverkets fortsatta affärsutveckling. Detta uppnås genom en tydlig IT-strategi, övergripande IT-arkitektur, aktiv leverantörsstyrning och effektiv systemförvaltning. IT-enheten är systemägare för Sjöfartsverkets IT-infrastruktur och svarar operativt för användarstöd, drift av IT-infrastrukturen, systemutveckling och IT-säkerhet. Peter Geite är chef för IT-enheten.
Enheten för Verksamhetsutveckling har det strategiska ansvaret för verksamhetens ledningssystem. Enheten ansvarar för att det i enlighet med ISO9001 finns förutsättningar för ett ändamålsenligt, effektivt och flexibelt ledningssystem för hela Sjöfartsverket. Annakarin Nilsson är chef för Verksamhetsutveckling.