Riksdagen fattade den 22 juni 2010 beslut om ny målstruktur för miljöarbetet. Bland annat ersätts delmål av etappmål som regeringen ska fastställa. Nedan beskrivs delmålen som har slutrapporterats och som ska ersättas.
Naturvårdsverket ansvarar bland annat för miljömålssystemet och samordningen av myndigheternas miljömålsuppföljning. Arbetet med den fördjupade utvärderingen av miljökvalitetsmålen som ska vara klar år 2012 (FU12) pågår. FU12 leds av Naturvårdsverket.
Nedan räknas för sjöfarten relevanta delmål till de nationella miljökvalitetsmålen upp. Delmålen har slutredovisats bl.a. eftersom flera av målåren har passerats.Delmålet för det nationella miljökvalitetsmålet ”Begränsad klimatpåverkan” innebär att år 2010 ska de svenska utsläppen av växthusgaser ska, som ett medelvärde för perioden 2008–2012, vara minst fyra procent lägre än de var 1990.Ett delmål för det nationella miljökvalitetsmålet ”Bara naturlig försurning” innebär att år 2010 ska utsläppen i Sverige av kväveoxider till luft ha minskat till 148 000 ton.Ett annat delmål för det nationella miljökvalitetsmålet ”Bara naturlig försurning” innebär att år 2010 ska utsläppen i Sverige av svaveldioxid till luft ha minskat till 60 000 ton.Ett delmål för det nationella miljökvalitetsmålet ”Frisk luft” innebär att år 2010 ska utsläppen i Sverige av flyktiga organiska ämnen till luft ha minskat till 241 000 ton. Det omfattar endast NMVOC det vill säga inte metan.Med syftet att skydda människors hälsa och miljön från luftföroreningar finns ett antal miljökvalitetsnormer. Miljökvalitetsnormer finns för närvarande för högsta halt i utomhusluft av kvävedioxid, kväveoxider, svaveldioxid, bly, partiklar, bensen och koloxid.Det nationella delmålet för buller lyder: ”Antalet människor som utsätts för trafikbullerstörningar överstigande de riktvärden som riksdagen ställt sig bakom för buller i bostäder ska ha minskat med fem procent till år 2010 jämfört med 1998.” Delmålet rör inte främst sjöfartens bulleremissioner, men riksdagen har också slagit fast ett delmål för buller som gäller sjöfart, nämligen ”Buller och andra störningar från båttrafik ska vara försumbara inom särskilt känsliga områden och utpekade skärgårds- och kustområden senast 2010.” Det hör till miljökvalitetsmålet ”Hav i balans samt levande kust och skärgård”.Ett annat delmål, ”Hav i balans samt levande kust och skärgård”, rör sjöfarten direkt; ”Genom skärpt lagstiftning och ökad övervakning ska utsläppen av olja och kemikalier från fartyg minimeras och vara försumbara senast år 2010.”